RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454741.5

TTC28-AS1-219, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,064 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PROSER3Q2NL68 480 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CAPN7Q9Y6W3 813 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TXNDC9O14530 226 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCNA1P78396 465 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CYP4A11Q02928 519 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KIF22Q14807 665 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ARHGEF6Q15052 776 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCDC151A5D8V7 595 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 A6NJR5 290 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF577Q9BSK1 485 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 VPS41P49754 854 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 M0R2C6 588 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PANX2Q96RD6 677 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LRRC63Q05C16 580 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PRPSAP1Q14558 356 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DOK7Q18PE1 504 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TBCKQ8TEA7 893 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HAUS8Q9BT25 410 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OATP04181 439 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KCTD2Q14681 263 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MUM1Q2TAK8 710 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BBS5Q8N3I7 341 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MTA3Q9BTC8 594 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ARHGAP42A6NI28 874 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 INHBAP08476 426 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NLRP10Q86W26 655 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HVCN1Q96D96 273 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HEG1Q9ULI3 1381 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 H7C0C1 242 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BMP3P12645 472 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ATP5OP48047 213 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ATP1A2P50993 1020 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RBL2Q08999 1139 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RESTQ13127 1097 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MESDQ14696 234 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PLCB4Q15147 1175 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DGKHQ86XP1 1220 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 VSTM4Q8IW00 320 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ERBB3P21860 1342 aa16.58■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ASPHQ12797 758 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PPP2R5CQ13362 524 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SURF1Q15526 300 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DBN1Q16643 649 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KRT3P12035 628 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PTPREP23469 700 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NECTIN1Q15223 517 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF653Q96CK0 615 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MAPK4P31152 587 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FAM160B2Q86V87 743 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCDC197Q8NCU1 140 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GBP5Q96PP8 586 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SERPINB2P05120 415 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLMAPQ14BN4 828 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PTCH1Q13635 1447 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms