RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 POLR3EQ9NVU0 708 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 CDH23Q9H251 3354 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 COL6A3P12111 3177 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 A6NJR5 290 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 GH1P01241 217 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 MMP3P08254 477 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 ACRP10323 421 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 NBPF20Q3BBV1 942 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 FAM47CQ5HY64 1035 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 USP17L6PQ6QN14 398 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 FAM161BQ96MY7 647 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 MAP3K14Q99558 947 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.153e-24■□□□□ 9.6
PRAME-209ENST00000439106 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 PTPRSQ13332 1948 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 CYP2C9P11712 490 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 CCL23P55773 120 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 MFSD5Q6N075 450 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 APOA5Q6Q788 366 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 TMTC2Q8N394 836 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 HIPK3Q9H422 1215 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 CALM1P0DP23 149 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 CALM2P0DP24 149 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 CALM3P0DP25 149 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 FANCBQ8NB91 859 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 SCLYQ96I15 445 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 ZNF286BP0CG31 522 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 CCND2P30279 289 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 GNAQP50148 359 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 SP2Q02086 613 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 TRAF1Q13077 416 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 UBE2SQ16763 222 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 KAT2BQ92831 832 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 SNX14Q9Y5W7 946 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 MEIS2O14770 477 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 GGPS1O95749 300 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 SMARCA1P28370 1054 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 HSPA4P34932 840 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 TMEM240Q5SV17 173 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 TMEM199Q8N511 208 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-209ENST00000439106 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 ZBTB43O43298 467 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 CDC27P30260 824 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 APOBRQ0VD83 1088 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 SEMA3FQ13275 785 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 KRT32Q14532 448 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 RTN1Q16799 776 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 GPR153Q6NV75 609 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 ZNF365Q70YC5 407 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 CUL5Q93034 780 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 ALG1Q9BT22 464 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 MTMR10Q9NXD2 777 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 WDR81Q562E7 1941 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZUG5 572 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms