RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429295.1

MRPL23-206, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL23, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-206ENST00000429295 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.39■■□□□ 1.66
MRPL23-206ENST00000429295 MYH6P13533 1939 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 KPNA6O60684 536 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 SMARCA1P28370 1054 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 CYP2C18P33260 490 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 HIPK3Q9H422 1215 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 A6NJR5 290 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 CALM1P0DP23 149 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 CALM2P0DP24 149 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 CALM3P0DP25 149 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF365Q70YC5 407 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 GH1P01241 217 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 NEFLP07196 543 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 LY6KQ17RY6 165 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 NEK1Q96PY6 1258 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 IL23AQ9NPF7 189 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 PBX4Q9BYU1 374 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 B4GALT4O60513 344 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 PBX2P40425 430 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 FGBP02675 491 aa25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 RXRAP19793 462 aa25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 CCL23P55773 120 aa25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 ARHGAP1Q07960 439 aa25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 PGM5Q15124 567 aa25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 AFG1LQ8WV93 481 aa25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 MSRAQ9UJ68 235 aa25.33■■□□□ 1.65
MRPL23-206ENST00000429295 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 KRT32Q14532 448 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 RASIP1Q5U651 963 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 RASEFQ8IZ41 740 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 FANCBQ8NB91 859 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.32■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 CHD9Q3L8U1 2897 aa25.31■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 CCND2P30279 289 aa25.31■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 RAB30Q15771 203 aa25.31■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.31■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.31■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 HERVK_113Q902F9 699 aa25.31■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 MMP3P08254 477 aa25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 LAMC2Q13753 1193 aa25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 MICU3Q86XE3 530 aa25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 PPM1EQ8WY54 764 aa25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 CUL5Q93034 780 aa25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 RGS20O76081 388 aa25.29■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.29■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 USP38Q8NB14 1042 aa25.29■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 IL31RAQ8NI17 732 aa25.29■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.29■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 SCN5AQ14524 2016 aa25.29■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 TGFB3P10600 412 aa25.28■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 CHMP4BP1P59074 171 aa25.28■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 DGKDQ16760 1214 aa25.28■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.28■■□□□ 1.64
MRPL23-206ENST00000429295 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms