RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 RTN1Q16799 776 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 LRCH3Q96II8 777 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 A6NJR5 290 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP1Q07960 439 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 CUL5Q93034 780 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 KPNA6O60684 536 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 RGS20O76081 388 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 CD4P01730 458 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 CCND2P30279 289 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 Q6ZUG5 572 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 AFG1LQ8WV93 481 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.33■■□□□ 1.33
ANKRD39-201ENST00000393537 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.33■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 TIMP1P01033 207 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.32■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 PIK3CDO00329 1044 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 MEIS2O14770 477 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP3P08254 477 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 FPGSQ05932 587 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 SHHQ15465 462 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 BRF1Q92994 677 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 B4GALT4O60513 344 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS6KB1P23443 525 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMA5P28066 241 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 EPHB4P54760 987 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 APOBRQ0VD83 1088 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC27P30260 824 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 RCAN1P53805 252 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 FUT2Q10981 343 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 LAMC2Q13753 1193 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 MFSD5Q6N075 450 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 USP26Q9BXU7 913 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 SORBS3O60504 671 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 CHMP4BP1P59074 171 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 GGPS1O95749 300 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 TGFB3P10600 412 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2C18P33260 490 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 SP2Q02086 613 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE2SQ16763 222 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 HIPK3Q9H422 1215 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD39-201ENST00000393537 STAM2O75886 525 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 DGKDQ16760 1214 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 GNPTABQ3T906 1256 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXL16Q8N461 479 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM199Q8N511 208 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 PPTC7Q8NI37 304 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 CSF2RAP15509 400 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 NAPAP54920 295 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.314e-12■■■■□ 25.5
ANKRD39-201ENST00000393537 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD39-201ENST00000393537 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms