RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 LPXNO60711 386 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 NBNO60934 754 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PDE4AP27815 886 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PTGISQ16647 500 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM67Q5HYA8 995 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SESTD1Q86VW0 696 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KAT14Q9H8E8 782 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RAD50Q92878 1312 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GH1P01241 217 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF286BP0CG31 522 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 BMP1P13497 986 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RFC2P35250 354 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HSD17B4P51659 736 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KCNQ1P51787 676 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 DEFB103AP81534 67 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GHRHRQ02643 423 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MBTPS1Q14703 1052 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 IQCA1Q86XH1 822 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 FBXO11Q86XK2 927 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PXMP2Q9NR77 195 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HAS3O00219 553 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SORBS3O60504 671 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 NR3C2P08235 984 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SP2Q02086 613 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 RBL2Q08999 1139 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 IWS1Q96ST2 819 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SLC9A7Q96T83 725 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 BRWD1Q9NSI6 2320 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CFBP00751 764 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CXCL10P02778 98 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 BFSP2Q13515 415 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 STXBP2Q15833 593 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 RETREG2Q8NC44 543 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 OSBPL7Q9BZF2 842 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CYTH3O43739 400 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 F2P00734 622 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CKBP12277 381 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SELPP16109 830 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PSEN2P49810 448 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PTH1RQ03431 593 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 GRB10Q13322 594 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ALG1Q9BT22 464 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MAF1Q9H063 256 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MYH6P13533 1939 aa15.49■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 KLRF2D3W0D1 207 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ACTN1P12814 892 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MFSD10Q14728 455 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 DGKDQ16760 1214 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms