RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SMPD1P17405 629 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 MCM2P49736 904 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 GJA9P57773 515 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 AP3B2Q13367 1082 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC41Q15345 812 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 GNPTABQ3T906 1256 aa17.63■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 STK36Q9NRP7 1315 aa17.63■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZEB2O60315 1214 aa17.62■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 NLRX1Q86UT6 975 aa17.61■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 CEP290O15078 2479 aa17.61■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 LARGE1O95461 756 aa17.6■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.59■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 PHF24Q9UPV7 400 aa17.59■□□□□ 0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 CABYRO75952 493 aa17.58■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ACLYP53396 1101 aa17.58■□□□□ 0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 KCNA10Q16322 511 aa17.58■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa17.58■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC83Q8IWF9 413 aa17.58■□□□□ 0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 ALG1Q9BT22 464 aa17.58■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.58■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 MAFGO15525 162 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 KPNA6O60684 536 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 RGS20O76081 388 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ICAM3P32942 547 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SREBF1P36956 1147 aa17.57■□□□□ 0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 LAMC2Q13753 1193 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 LY6KQ17RY6 165 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 GPRASP2Q96D09 838 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 GLT1D1Q96MS3 346 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM260Q9NX78 707 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 RTEL1Q9NZ71 1219 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa17.56■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ARIH2O95376 493 aa17.56■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF76P36508 570 aa17.56■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 NEDD9Q14511 834 aa17.56■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 BLIDQ8IZY5 108 aa17.56■□□□□ 0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 DAGLBQ8NCG7 672 aa17.56■□□□□ 0.4
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