RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363613.1

RNU6-1017P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1017, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1017P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1017P-201ENST00000363613 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF202O95125 648 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MYL1P05976 194 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC10A3P09131 477 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MUTP22033 750 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TXKP42681 527 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 KIF22Q14807 665 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 STXBP2Q15833 593 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FAM110CQ1W6H9 321 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PRR16Q569H4 304 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RRAGBQ5VZM2 374 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RASAL3Q86YV0 1011 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CNNM3Q8NE01 707 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 BRI3BPQ8WY22 251 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PGBD1Q96JS3 809 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MBOAT7Q96N66 472 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MMP19Q99542 508 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MXRA8Q9BRK3 442 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CREBZFQ9NS37 354 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DACT1Q9NYF0 836 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LRWD1Q9UFC0 647 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PARP14Q460N5 1801 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RLFQ13129 1914 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 A0A1B0GVL5 298 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MEIS1O00470 390 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NFIBO00712 420 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GAS7O60861 476 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NR3C2P08235 984 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CCDC192P0DO97 292 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TGFB3P10600 412 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ERCC3P19447 782 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GJA5P36382 358 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TM4SF4P48230 202 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 APLP1P51693 650 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PDE4DQ08499 809 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DGKZQ13574 1117 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MOGSQ13724 837 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CABP7Q86V35 215 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NEK9Q8TD19 979 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GPT2Q8TD30 523 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GPRASP2Q96D09 838 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SHISA4Q96DD7 197 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RIT2Q99578 217 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ZNF577Q9BSK1 485 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CSRNP2Q9H175 543 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 JADE2Q9NQC1 790 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PXMP2Q9NR77 195 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FAM205CA6NFA0 338 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TDP2O95551 362 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SLFN14P0C7P3 912 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PFKFB1P16118 471 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SFNP31947 248 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 STAT6P42226 847 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TECP42680 631 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 NDUFA8P51970 172 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PGM5Q15124 567 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 DPP9Q86TI2 863 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 POTEDQ86YR6 584 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 IFNL1Q8IU54 200 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 RDM1Q8NG50 284 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 CRYGNQ8WXF5 182 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TBC1D5Q92609 795 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 MTMR9Q96QG7 549 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1017P-201ENST00000363613 ANO10Q9NW15 660 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms