RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.515e-11■■■□□ 15.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYL5Q02045 173 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP49Q70CQ1 688 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 BTBD18B2RXH4 712 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMIM22K7EJ46 135 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 CMA1P23946 247 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCND1P24385 295 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC39A14Q15043 492 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 METTL24Q5JXM2 366 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM50Q86XT4 487 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 HDAC7Q8WUI4 952 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 IWS1Q96ST2 819 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDH18Q9HCL0 1135 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPME1Q9Y570 386 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.86□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSMC4P43686 418 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 STAMQ92783 540 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLGA8AA7E2F4 631 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 GSTT1P30711 240 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 OXCT1P55809 520 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 KCNJ2P63252 427 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 NR5A1Q13285 461 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 POSTNQ15063 836 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAGE1Q8TC20 777 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP33Q8TEY7 942 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMCO1Q9UM00 188 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.85□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM205CA6NFA0 338 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 FLOT1O75955 427 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 HOXD12P35452 270 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 HDAC4P56524 1084 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 C2orf54Q08AI8 447 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMED1Q13445 227 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 OLFM4Q6UX06 510 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 APPBP2Q92624 585 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTPAQ15257 358 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 APOA5Q6Q788 366 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 TTC30AQ86WT1 665 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 SERTAD1Q9UHV2 236 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 TACC3Q9Y6A5 838 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP54Q70EL1 1684 aa11.84□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.83□□□□□ -0.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0G2JS52 829 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRKAB2O43741 272 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMOD1P28289 359 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM67Q5HYA8 995 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 CXorf38Q8TB03 319 aa11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 GREM2Q9H772 168 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms