RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SUGCTQ9HAC7 445 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD35Q8N283 1001 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CSRNP1Q96S65 589 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 Q9H521 79 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CD2APQ9Y5K6 639 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 METP08581 1390 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 DOK7Q18PE1 504 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 LCORLQ8N3X6 602 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ACCSQ96QU6 501 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SASH1O94885 1247 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SNCBQ16143 134 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC4Q96A65 974 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 NACC1Q96RE7 527 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SARM1Q6SZW1 724 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF653Q96CK0 615 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 HINFPQ9BQA5 517 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 EFCC1Q9HA90 598 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 KAZNQ674X7 775 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CNKSR1Q969H4 720 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM206Q9H813 350 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 TMOD1P28289 359 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC41Q15345 812 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 MED10Q9BTT4 135 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 INHBAP08476 426 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 H7C0C1 242 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5OP48047 213 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PAGE5Q96GU1 130 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WWV3 80 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK4P31152 587 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 DMTNQ08495 405 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAB2O43741 272 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SERPING1P05155 500 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ECEL1O95672 775 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ABCD1P33897 745 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP10Q86W26 655 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC63Q05C16 580 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 IFT88Q13099 833 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 NXNQ6DKJ4 435 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PIGSQ96S52 555 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PBRM1Q86U86 1689 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 IFNAR2P48551 515 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 TFDP1Q14186 410 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 DBN1Q16643 649 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 WHAMMQ8TF30 809 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ALS2CLQ60I27 953 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 BAG2O95816 211 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PLTPP55058 493 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CEP170Q5SW79 1584 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 A6NJR5 290 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SGO2Q562F6 1265 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SPC25Q9HBM1 224 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYND10O75800 440 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CLCN6P51797 869 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PI16Q6UXB8 463 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.95■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SLMAPQ14BN4 828 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms