RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 A0A0G2JND7 137 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MCF2P10911 925 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ADGRL1O94910 1474 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CYP2J2P51589 502 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ACSL3O95573 720 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 HIPK4Q8NE63 616 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CD248Q9HCU0 757 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CCND1P24385 295 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 GARSP41250 739 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 AZI2Q9H6S1 392 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZBBXA8MT70 800 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TMEM154Q6P9G4 183 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NUDCD3Q8IVD9 361 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SCYL1Q96KG9 808 aa17.39■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 HAUS5O94927 633 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 IRAK1P51617 712 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 RUBCNQ92622 972 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 HAUS7Q99871 368 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CYP21A2P08686 494 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 HADHQ16836 314 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 KAZNQ674X7 775 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CDKL2Q92772 493 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB10Q96DT7 871 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PLA2G4AP47712 749 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TTLL11Q8NHH1 800 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 DENND2AQ9ULE3 1009 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 FAM133AQ8N9E0 248 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ANO5Q75V66 913 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NUB1Q9Y5A7 615 aa17.38■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 MAEAQ7L5Y9 396 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TNRQ92752 1358 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 RNMTO43148 476 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CD19P15391 556 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 JDP2Q8WYK2 163 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 KDM1AO60341 852 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 FGAP02671 866 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 GCKRQ14397 625 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PLBD2Q8NHP8 589 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NBPF3Q9H094 633 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 BAG5Q9UL15 447 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ESYT3A0FGR9 886 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 LDHBP07195 334 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa17.37■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SMCO2A6NFE2 343 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PODXLO00592 558 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PDE1BQ01064 536 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ATG16L1Q676U5 607 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TTC1Q99614 292 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 HPCAL4Q9UM19 191 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 RGS9BPQ6ZS82 235 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 HOOK2Q96ED9 719 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 FANCAO15360 1455 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ART3Q13508 389 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 MCF2LO15068 1137 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CCNE1P24864 410 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SESTD1Q86VW0 696 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SGK1O00141 431 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PALMO75781 387 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 FGGP02679 453 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 MYL1P05976 194 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SCG2P13521 617 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CNGA1P29973 690 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PAGE5Q96GU1 130 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SNX24Q9Y343 169 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PZPP20742 1482 aa17.36■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 CFLARO15519 480 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 PLS3P13797 630 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 KCNA3P22001 575 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 SCP2P22307 547 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ZNF804AQ7Z570 1209 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 FAM161BQ96MY7 647 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 ABCC1P33527 1531 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-201ENST00000256413 RFX1P22670 979 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms