RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nbr1P97432 988 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfm4Q3UZZ4 505 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mov10l1Q99MV5 1187 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pla2g6P97819 807 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ces4aQ8R0W5 563 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9D5Q8 446 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bpifb4A2BGH0 617 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Neurl1bQ0MW30 546 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim47Q8C0E3 641 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa13.15□□□□□ -0.3
Herc3-201ENSMUST00000031823 JcadQ5DTX6 1320 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 E4f1Q8CCE9 783 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oip5A2AQ14 241 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Traf5P70191 558 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sox10Q04888 466 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfap45Q9D9U9 551 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 GsdmeQ9Z2D3 512 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim9Q8C7M3 817 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ivns1abpQ920Q8 642 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alpk1Q9CXB8 1231 aa13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdc27A2A6Q5 825 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3095E9Q058 166 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cavin1O54724 392 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 SfnO70456 248 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 P4ha1Q60715 534 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 BcrQ6PAJ1 1270 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tacc2Q9JJG0 1149 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plcg1Q62077 1302 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rasa2P58069 847 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lmntd2Q0VET5 664 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Herc4Q6PAV2 1057 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pgm5Q8BZF8 567 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Haus2Q9CQS9 234 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Josd2Q9CR30 188 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 PycardQ9EPB4 193 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dctpp1Q9QY93 170 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vav3Q9R0C8 847 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Uchl5Q9WUP7 329 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa13.13□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10436L7N1Y3 520 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hmx1O70218 332 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itgb5O70309 798 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mier3Q3UHF3 551 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rexo1Q7TT28 1213 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slu7Q8BHJ9 585 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Osbpl2Q8BX94 484 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 PpatQ8CIH9 517 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bcorl1A2AQH4 1781 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc25A2ALW5 357 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Herc3A6H6S0 1050 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tal1P22091 329 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nt5c2Q3V1L4 560 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ushbp1Q8R370 680 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exoc1Q8R3S6 894 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm4bQ91VY5 1086 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a38Q91XD8 326 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdha12Q91Y18 950 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elp3Q9CZX0 547 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lypla2Q9WTL7 231 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grin2dQ03391 1323 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 PgfP49764 158 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 MaeaQ4VC33 396 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sestd1Q80UK0 696 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rusc1Q8BG26 893 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Med24Q99K74 987 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chaf1aQ9QWF0 911 aa13.12□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pak1O88643 545 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magea8O89012 320 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 EzrP26040 586 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 4933427I04RikQ3V053 235 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nlgn2Q69ZK9 836 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exoc3Q6KAR6 755 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lca5lQ8C0X0 741 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 AacsQ9D2R0 672 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcna3P16390 528 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Erbb2P70424 1256 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnk13Q8R1P5 405 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 MyocdQ8VIM5 935 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Git2Q9JLQ2 708 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magi2Q9WVQ1 1275 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11549A0A286YD83 63 aa13.11□□□□□ -0.31
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7168A0AUV4 508 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms