RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrc37aB1AWG4 3215 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rev3lQ61493 3122 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 DhpsQ3TXU5 369 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mdh1bQ5F204 500 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm11487Q5RIS0 354 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc82Q6PG04 518 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ush1gQ80T11 461 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atg4cQ811C2 458 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bmp3Q8BHE5 468 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm5591Q8CDK1 855 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pus7lQ8CE46 702 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Celf3Q8CIN6 465 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp2a1Q8R429 994 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Oit3Q8R4V5 546 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Inpp4aQ9EPW0 939 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc5a4aQ9ET37 656 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa22.17■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prr16A3KMN5 304 aa22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gucy1a2F8VQK3 730 aa22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 2610008E11RikG3X964 669 aa22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm16427J3QN52 483 aa22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Il4rP16382 810 aa22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Taf1bP97358 586 aa22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scg2Q03517 617 aa22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 P3h1Q3V1T4 739 aa22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa22.15■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa22.15■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc2a12Q8BFW9 622 aa22.15■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Casp12O08736 419 aa22.14■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spink5Q148R4 1017 aa22.14■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nek11Q8C0Q4 628 aa22.14■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eif4e3Q9DBB5 207 aa22.14■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ifi202Q9R002 445 aa22.14■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa22.13■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 TbcaP48428 108 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Etv6P97360 485 aa22.13■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Oxr1Q4KMM3 866 aa22.13■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Usp20Q8C6M1 916 aa22.13■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tceal5Q8CCT4 200 aa22.13■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc5a5Q99PN0 618 aa22.13■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rlbp1Q9Z275 317 aa22.13■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Akap17bA2A3V1 959 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Diaph1O08808 1255 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stag2O35638 1231 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sptlc1O35704 473 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hoxc8P09025 242 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpr25P0C5I1 358 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pik3r1P26450 724 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 EdnrbP48302 442 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ctnna3Q65CL1 895 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spty2d1Q68FG3 682 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gja6Q6S5G4 283 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mindy1Q76LS9 468 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 St18Q80TY4 1045 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vps37dQ810I0 261 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Epha10Q8BYG9 1007 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rint1Q8BZ36 792 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dmtf1Q8CE22 761 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrfip2Q91WK0 415 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mfsd5Q921Y4 450 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 GhdcQ99J23 532 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kank3Q9Z1P7 791 aa22.12■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 AspmQ8CJ27 3122 aa22.11■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm13941A2AJ38 245 aa22.11■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dcpp3L7N259 170 aa22.11■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aff3P51827 1254 aa22.11■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 LrmpQ60664 539 aa22.11■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lca5Q80ST9 704 aa22.11■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fut11Q8BHC9 489 aa22.11■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bmpr1aP36895 532 aa22.1■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 ZbbxQ0P5X5 716 aa22.1■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hoxa13Q62424 386 aa22.1■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa22.1■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc15a2Q9ES07 729 aa22.1■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 LdhaP06151 332 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 1700013D24RikQ0P521 120 aa22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prdm1Q60636 856 aa22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myl10Q62082 202 aa22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 IqceQ6PCQ0 778 aa22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eml3Q8VC03 897 aa22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kdm4bQ91VY5 1086 aa22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tfap4Q9JIZ5 338 aa22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ly6g6dQ9Z1Q3 135 aa22.09■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 EporP14753 507 aa22.08■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Il1rapl1P59823 695 aa22.08■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nhlh1Q02576 133 aa22.08■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mgat3Q10470 538 aa22.08■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eif3j2Q66JS6 263 aa22.08■■□□□ 1.13
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrc15Q80X72 579 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms