RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	PRD1	P25375	712 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	VPS17	P32913	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	ECM15	P35195	104 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	AVT5	P38176	459 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	RTT101	P47050	842 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	RSM23	Q01163	450 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	AIM32	Q04689	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	CBS2	P14905	389 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	SEC62	P21825	274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	YCR051W	P25631	222 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	MSR1	P38714	643 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	YJL213W	P40896	331 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	BOR1	P53838	576 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	CDC45	Q08032	650 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	SEC39	Q12745	709 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MGR3	YMR115W	CLB1	P24868	471 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	NDC1	P32500	655 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	CIN4	P39110	191 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	RPH1	P39956	796 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	RPR2	P40571	144 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	COS10	P52924	374 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	RCF1	Q03713	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	COQ9	Q05779	260 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	AFI1	Q99222	893 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	AGA1	P32323	725 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	ZIM17	P42844	174 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	DUG3	P53871	357 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SMA2	Q04658	369 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SET6	Q12529	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	OPI1	P21957	404 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	TFB1	P32776	642 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SEC66	P33754	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YGR126W	P53274	230 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	RHO4	Q00246	291 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	CIK1	Q01649	594 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	MSC1	Q03104	513 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	ROY1	Q04847	553 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	VTA1	Q06263	330 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SPC110	P32380	944 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	PTR2	P32901	601 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	APE1	P14904	514 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	PPH22	P23595	377 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	JEM1	P40358	645 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	TOF2	Q02208	771 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	GYL1	Q04322	720 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	GLO2	Q05584	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	CLC1	P17891	233 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	ELO2	P25358	347 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	HCS1	P34243	683 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	APE4	P38821	490 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	CSM2	P40465	213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	LCB2	P40970	561 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	YJL132W	P47014	750 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	AIM22	P47051	409 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	AYT1	Q12226	474 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	ISN1	Q99312	450 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
MGR3	YMR115W	MNE1	P24720	663 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	TUL1	P36096	758 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	VPS52	P39904	641 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	SNG1	P46950	547 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MGR3	YMR115W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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