RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	PMU1	P36069	295 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	CST26	P38226	397 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	YEL057C	P39983	233 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	ALG8	P40351	577 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	SPO22	P40511	975 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	ELP2	P42935	788 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	TIM10	P87108	93 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	SEC39	Q12745	709 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	RAV1	P47104	1357 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	HEM2	P05373	342 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	TUL1	P36096	758 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	HAT2	P39984	401 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	YJL132W	P47014	750 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3	□□□□□ -1.93	not detected
YCT1	YLL055W	COG4	Q06096	861 aa		3	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	ARG3	P05150	338 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	YBP1	P38315	674 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	TWF1	P53250	332 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	PDS5	Q04264	1277 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	MRP7	P12687	371 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	ATP11	P32453	318 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	RPN12	P32496	274 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
YCT1	YLL055W	POP1	P41812	875 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	IDP2	P41939	412 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	GWT1	P47026	490 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	SLG1	P54867	378 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	RKM5	Q12367	367 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	VID24	P38263	362 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	URB2	P47108	1174 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	BOR1	P53838	576 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	ATG29	Q12092	213 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	CTF3	Q12748	733 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YCT1	YLL055W	CBS2	P14905	389 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	BUB3	P26449	341 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	CMC1	P36064	111 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	MET18	P40469	1032 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	SYG1	P40528	902 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	WSC2	P53832	503 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	RIM20	Q12033	661 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YLL056C	Q12177	298 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YML133C	Q03099	1374 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YLL067C	Q07888	1374 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YLL066C	Q99208	1374 aa		2.96	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	SEC66	P33754	206 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	PMT1	P33775	817 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	FRE2	P36033	711 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	RSM22	P36056	628 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	PCA1	P38360	1216 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	FAU1	P40099	211 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	TLG2	Q08144	397 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	GPI10	P30777	616 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	JNM1	P36224	373 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	CBP4	P37267	147 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	AVT5	P38176	459 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	HXT14	P42833	540 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YGL108C	P53139	140 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	JJJ1	P53863	590 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	TAP42	Q04372	366 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	HNT3	Q08702	217 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.95	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	PMR1	P13586	950 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	RAD14	P28519	371 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YBR139W	P38109	508 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	NDE1	P40215	560 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	ESL1	P40456	1118 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	IRC6	P43615	237 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	PIR3	Q03180	325 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.94	□□□□□ -1.94	not detected
YCT1	YLL055W	RSA1	Q08932	381 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	RTP1	Q12751	981 aa		2.94	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	MET17	P06106	444 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	RHO2	P06781	192 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	CKA1	P15790	372 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	YPI1	P43587	155 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	ARK1	P53974	638 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	SOV1	Q04748	898 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YCT1	YLL055W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94

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