RNA–Protein interactions for RNA: YHL028W

WSC4, Transcript of Endoplasmic reticulum (ER) membrane protein, yeast

Gene WSC4, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSC4	YHL028W	PET130	P47065	347 aa		7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	KEL2	P50090	882 aa		7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	FRE4	P53746	719 aa		7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	YPL034W	Q03083	165 aa		7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	PIR1	Q03178	341 aa		7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	YMR010W	Q03687	405 aa		7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	COA4	Q05809	96 aa		7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	YLR413W	Q06689	675 aa		7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	IRC10	Q08118	586 aa		7.6	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	HMG2	P12684	1045 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	MRP13	P12686	339 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	CMK2	P22517	447 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	EMC1	P25574	760 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	SDH3	P33421	198 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	THI80	P35202	319 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	YHL012W	P38709	493 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	PET100	P38958	111 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	MEP2	P41948	499 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	BIR1	P47134	954 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	MON1	P53129	644 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	SHY1	P53266	389 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	YMR206W	Q03695	313 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	GAL83	Q04739	417 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	NUT2	Q06213	157 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	BRE4	Q07660	1125 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	MET17	P06106	444 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	CDC21	P06785	304 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	IDI1	P15496	288 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	GEX1	P25596	615 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	UBC8	P28263	218 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	SYN8	P31377	255 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	GEX2	P36173	615 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	YHR218W	P38899	603 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	GCD10	P41814	478 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	SIP4	P46954	829 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	TLG1	Q03322	224 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	RCF1	Q03713	159 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	ERF2	Q06551	359 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	UAF30	Q08747	228 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	RSA1	Q08932	381 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	FLC1	Q08967	793 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	MMP1	Q12372	583 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	MED11	Q99278	115 aa		7.59	□□□□□ -1.19
WSC4	YHL028W	PHO5	P00635	467 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	SPT3	P06844	337 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	DAL81	P21657	970 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	MTW1	P39731	289 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	GAT1	P43574	510 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	IRC6	P43615	237 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.58	□□□□□ -1.2	not detected
WSC4	YHL028W	AIM14	P53109	570 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	RSC9	Q03124	581 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	GPI11	Q06636	219 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	YPL191C	Q08930	360 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	MNL2	Q12205	849 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	BBP1	Q12365	385 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	VPS13	Q07878	3144 aa		7.58	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TIM9	O74700	87 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	OCA4	P25366	362 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	NTG1	P31378	399 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TIM17	P39515	158 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	GDH3	P39708	457 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	GTO1	P48239	356 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	IPI3	P53877	555 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TOF2	Q02208	771 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	YML108W	Q03759	105 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	FIN1	Q03898	291 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	PEX12	Q04370	399 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	YDR124W	Q04608	324 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	YDL121C	Q07541	149 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	MED2	Q12124	431 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		7.57	□□□□□ -1.2
WSC4	YHL028W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		7.57	□□□□□ -1.2

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