RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641923.1

SAMMSON-223, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

Gene SAMMSON, Length 1,213 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-223	ENST00000641923	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	ASB14	A6NK59	587 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	GPR25	O00155	361 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	NFIB	O00712	420 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MEIS2	O14770	477 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PPFIA3	O75145	1194 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	BMP15	O95972	392 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	HOXC6	P09630	235 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PTPRE	P23469	700 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	RGS2	P41220	211 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	USP11	P51784	963 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	TERF1	P54274	439 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	GRB14	Q14449	540 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923		Q3C1V9	767 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MCTP1	Q6DN14	999 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	AIFM3	Q96NN9	605 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MTMR6	Q9Y217	621 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	RIPK3	Q9Y572	518 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923		M0R2N6	131 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	TBC1D8	O95759	1140 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CLCN1	P35523	988 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	SREBF1	P36956	1147 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MAP2K5	Q13163	448 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	DPP9	Q86TI2	863 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	ANO3	Q9BYT9	981 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PORCN	Q9H237	461 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	EFCC1	Q9HA90	598 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	LAD1	O00515	517 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	OPLAH	O14841	1288 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MAFG	O15525	162 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	BRD1	O95696	1058 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	F13A1	P00488	732 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	TPM2	P07951	284 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CYP3A4	P08684	503 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	ADORA2A	P29274	412 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CCND2	P30279	289 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	DDIT3	P35638	169 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PSMC4	P43686	418 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	NPY5R	Q15761	445 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MORN1	Q5T089	497 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	NEK8	Q86SG6	692 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	APBA2	Q99767	749 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	BTBD18	B2RXH4	712 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CIITA	P33076	1130 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	GUCY1B3	Q02153	619 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	STXBP2	Q15833	593 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SAMMSON-223	ENST00000641923	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77

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