RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637243.1

CHRNA4-218, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 85 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-218ENST00000637243 MYL3P08590 195 aa7□□□□□ -1.29
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CHRNA4-218ENST00000637243 VCPP55072 806 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CHRNA4-218ENST00000637243 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CHRNA4-218ENST00000637243 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7□□□□□ -1.29
CHRNA4-218ENST00000637243 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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CHRNA4-218ENST00000637243 FAM117BQ6P1L5 589 aa7□□□□□ -1.29
CHRNA4-218ENST00000637243 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CHRNA4-218ENST00000637243 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
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CHRNA4-218ENST00000637243 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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CHRNA4-218ENST00000637243 ARP10275 920 aa6.97□□□□□ -1.29
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CHRNA4-218ENST00000637243 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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