RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625216.2

PNKP-217, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 5

Gene PNKP, Length 629 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-217ENST00000625216 TLK2Q86UE8 772 aa14.64□□□□□ -0.07
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PNKP-217ENST00000625216 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.64□□□□□ -0.07
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PNKP-217ENST00000625216 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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PNKP-217ENST00000625216 TBX21Q9UL17 535 aa14.59□□□□□ -0.07
PNKP-217ENST00000625216 SZT2Q5T011 3432 aa14.59□□□□□ -0.07
PNKP-217ENST00000625216 A6NJR5 290 aa14.58□□□□□ -0.08
PNKP-217ENST00000625216 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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