RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PKP1Q13835 747 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGEF6Q15052 776 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCL14Q16627 93 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RGS22Q8NE09 1264 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IL31RAQ8NI17 732 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAET1EQ8TD07 263 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PXMP2Q9NR77 195 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SRRDQ9UH36 339 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIK3CDO00329 1044 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ELNP15502 786 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HOXD10P28358 340 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AP3B2Q13367 1082 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GALNT17Q6IS24 598 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAML3Q96JK9 1138 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FGD4Q96M96 766 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC5A4Q9NY91 659 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GJD2Q9UKL4 321 aa16.62■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP2B1P20020 1258 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GHRHRQ02643 423 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDE4DQ08499 809 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 INF2Q27J81 1249 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTMR6Q9Y217 621 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PGM5Q15124 567 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBCKQ8TEA7 893 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP6NLQ92738 828 aa16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 M0R2N6 131 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCND2P30279 289 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP2C19P33261 490 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF76P36508 570 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGAP4P98171 946 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARMCX2Q7L311 632 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOSTRINQ8IVI9 506 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNERQ8NFT8 737 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIB2Q92519 343 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TNFRSF25Q93038 417 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UIMC1Q96RL1 719 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDCD2LQ9BRP1 358 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADCY3O60266 1144 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GNRH1P01148 92 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LETM2Q2VYF4 491 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPTORQ8N122 1335 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa16.58■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASB14A6NK59 587 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NR3C2P08235 984 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HOXC6P09630 235 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SREBF1P36956 1147 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM32Q13049 653 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RESTQ13127 1097 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NBR1Q14596 966 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCTP2Q6DN12 878 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM173BQ6P4H8 233 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SH3TC2Q8TF17 1288 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TINF2Q9BSI4 451 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.57■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 B4DLN1 442 aa16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SORBS3O60504 671 aa16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TDP2O95551 362 aa16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 F13A1P00488 732 aa16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MFSD14CQ5VZR4 134 aa16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NEK8Q86SG6 692 aa16.56■□□□□ 0.24
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAF1Q9H063 256 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms