RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	ZNF213	O14771	459 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	COL6A3	P12111	3177 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	RFC2	P35250	354 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	NUCB1	Q02818	461 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	BFSP2	Q13515	415 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	CA3	P07451	260 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	SDS	P20132	328 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	PTGIS	Q16647	500 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP36-223	ENST00000592326	ABCB11	O95342	1321 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326		A6NJR5	290 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	RFXAP	O00287	272 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	KDM4A	O75164	1064 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	GH1	P01241	217 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	KCNJ6	P48051	423 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	NEDD4	P46934	1319 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ARIH2	O95376	493 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	COL9A1	P20849	921 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	EDNRB	P24530	442 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	STXBP2	Q15833	593 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326		B4E1Z4	1266 aa		13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	MMP3	P08254	477 aa		13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	TLL1	O43897	1013 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	CFB	P00751	764 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	DGKD	Q16760	1214 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	HIP1	O00291	1037 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP36-223	ENST00000592326	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3

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