RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.36■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.36■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 MYO9BQ13459 2157 aa15.36■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 LCTP09848 1927 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 KIF28PB7ZC32 967 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 KPNA6O60684 536 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 PDHBP11177 359 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 EDNRBP24530 442 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 KCNJ6P48051 423 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 USH1GQ495M9 461 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 PNMA2Q9UL42 364 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 A6NJR5 290 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 TLL1O43897 1013 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 ARIH2O95376 493 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 HAND2P61296 217 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF543Q08ER8 600 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 PTGISQ16647 500 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 SPRED2Q7Z698 418 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC155Q8N6L0 562 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 COG5Q9UP83 839 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD4L-232ENST00000591579 B4DLN1 442 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 BAIAP3O94812 1187 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 GRB10Q13322 594 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 DNERQ8NFT8 737 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 AFG1LQ8WV93 481 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 HLA-CQ95604 372 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 EVI5LQ96CN4 794 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM227BQ96M60 508 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 WDR19Q8NEZ3 1342 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 A0A0D9SFI3 127 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 FGAP02671 866 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 MMP3P08254 477 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 FGRP09769 529 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ALX1Q15699 326 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 CHST3Q7LGC8 479 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 LCHNA4D1U4 455 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 CAGE1Q8TC20 777 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 CPVLQ9H3G5 476 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 MTUS1Q9ULD2 1270 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 GH1P01241 217 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 SELPP16109 830 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 DEFB103AP81534 67 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 SCN5AQ14524 2016 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 LY6KQ17RY6 165 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 TBC1D10CQ8IV04 446 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 UBA5Q9GZZ9 404 aa15.3■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 NEDD4P46934 1319 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 LPXNO60711 386 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 SNHG28P0DPA3 235 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ARHGAP1Q07960 439 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 C7orf31Q8N865 590 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 CRBNQ96SW2 442 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 REV3LO60673 3130 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCB11O95342 1321 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ZMYM6O95789 1325 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF286BP0CG31 522 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 SESTD1Q86VW0 696 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NEDD4L-232ENST00000591579 ESR2Q92731 530 aa15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms