RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576241.1

CCDC40-216, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 714 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-216ENST00000576241 DNERQ8NFT8 737 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 ANKS1AQ92625 1134 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 GPR37L1O60883 481 aa16■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 PTGS1P23219 599 aa16■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 TTC22Q5TAA0 569 aa16■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 RUFY2Q8WXA3 655 aa16■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 CPVLQ9H3G5 476 aa16■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 LAMA4Q16363 1823 aa16■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 RAD50Q92878 1312 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 CD4P01730 458 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 PDE4AP27815 886 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 MRE11P49959 708 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 CPT1AP50416 773 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 PPP2R5BQ15173 497 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 AAK1Q2M2I8 961 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 ADGRF4Q8IZF3 695 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 RGS22Q8NE09 1264 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 MAF1Q9H063 256 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 ABCB11O95342 1321 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 CSF2RAP15509 400 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 EDNRBP24530 442 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 TRDNQ13061 729 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 SCFD2Q8WU76 684 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 HIPK3Q9H422 1215 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 MYL3P08590 195 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 CYP2C18P33260 490 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 PSMC6P62333 389 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 RASIP1Q5U651 963 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 FBXO11Q86XK2 927 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 IL25Q9H293 177 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 GBF1Q92538 1859 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 GRIN2DO15399 1336 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 LCTP09848 1927 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 B4GALT4O60513 344 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 TMEM240Q5SV17 173 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 MSRAQ9UJ68 235 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC40-216ENST00000576241 KPNA6O60684 536 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 TTLL4Q14679 1199 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 RAB30Q15771 203 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 IL23AQ9NPF7 189 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 ERICH2A1L162 156 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 KLRF2D3W0D1 207 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 ACRP10323 421 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 CHMLP26374 656 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 SEC23AQ15436 765 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 ZNF365Q70YC5 407 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 IWS1Q96ST2 819 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 RMDN3Q96TC7 470 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 AMNQ9BXJ7 453 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 A6NJR5 290 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 CYP21A2P08686 494 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 CCL23P55773 120 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 STXBP2Q15833 593 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC40-216ENST00000576241 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms