RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568745.5

SNAP23-219, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 814 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-219	ENST00000568745	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-219	ENST00000568745	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-219	ENST00000568745	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-219	ENST00000568745	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ADCY3	O60266	1144 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	KRT1	P04264	644 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	GLI4	P10075	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	BCL6	P41182	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PEX10	O60683	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	NTRK1	P04629	796 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CYBB	P04839	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	FGFR1	P11362	822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	FPR2	P25090	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	LTBR	P36941	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	DLG4	P78352	724 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	NTRK3	Q16288	839 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CEP68	Q76N32	757 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	C22orf46	C9J442	243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ABLIM1	O14639	778 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	MSC	O60682	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	EPHB3	P54753	998 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PRR5	P85299	388 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	NR1I3	Q14994	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PKN1	Q16512	942 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CABP7	Q86V35	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	MKL1	Q969V6	931 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CDC6	Q99741	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	HRK	O00198	91 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	NFIB	O00712	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	MYO1B	O43795	1136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	SEMA7A	O75326	666 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CDR1	P51861	262 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	LSAMP	Q13449	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	TESK1	Q15569	626 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-219	ENST00000568745	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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