RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 COL20A1Q9P218 1284 aa21.87■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 FCER1AP12319 257 aa21.87■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 INF2Q27J81 1249 aa21.87■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.87■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 WDR81Q562E7 1941 aa21.86■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 GPR142Q7Z601 462 aa21.86■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 TBCKQ8TEA7 893 aa21.86■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.86■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.86■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 HTTP42858 3142 aa21.85■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 STRNO43815 780 aa21.85■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.85■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.85■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 ATP2B1P20020 1258 aa21.84■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 POTEB2H3BUK9 544 aa21.83■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 PTPREP23469 700 aa21.83■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 NEK8Q86SG6 692 aa21.83■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.83■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 RMDN3Q96TC7 470 aa21.83■■□□□ 1.09
CTU2-204ENST00000564105 GPR25O00155 361 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 SREBF1P36956 1147 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 TRAPPC10P48553 1259 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 UBXN2AP68543 259 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CNTN2Q02246 1040 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 PXMP2Q9NR77 195 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CENPFP49454 3210 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 RPTORQ8N122 1335 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 PGK2P07205 417 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ADORA2AP29274 412 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP4P98171 946 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 SP3Q02447 781 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 GRB14Q14449 540 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 RGS19P49795 217 aa21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 NBR1Q14596 966 aa21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 LETM2Q2VYF4 491 aa21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 TTC38Q5R3I4 469 aa21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 DNERQ8NFT8 737 aa21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 USP28Q96RU2 1077 aa21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 WNT7AO00755 349 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 EDIL3O43854 480 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 USP11P51784 963 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 KRT85P78386 507 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 PGM5Q15124 567 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ATL3Q6DD88 541 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 SOWAHBA6NEL2 793 aa21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CYP3A4P08684 503 aa21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CTGFP29279 349 aa21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CFAP45Q9UL16 551 aa21.79■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 COBLO75128 1261 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 PSMC4P43686 418 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 FCGRTP55899 365 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 KIF22Q14807 665 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ZNF174Q15697 407 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ANO1Q5XXA6 986 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 DPP9Q86TI2 863 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 IL31RAQ8NI17 732 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CLIC4Q9Y696 253 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ASTN1O14525 1302 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ZNF76P36508 570 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 MORN1Q5T089 497 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CTU2-204ENST00000564105 TDP2O95551 362 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms