RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKS1AQ92625 1134 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.63■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 TACC1O75410 805 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 MTMR7Q9Y216 660 aa20.62■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 MYH1P12882 1939 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 OR52Z1P0C646 297 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 HSPA1LP34931 641 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPP1R2P41236 205 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 CORO7P57737 925 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 SH2D4AQ9H788 454 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 USP17L3A6NCW0 530 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 USP17L4A6NCW7 530 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 C12orf60Q5U649 245 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 IQCDQ96DY2 449 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 DRC1Q96MC2 740 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.61■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 ITIH3Q06033 890 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 HPS3Q969F9 1004 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 GYS1P13807 737 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 LETM2Q2VYF4 491 aa20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 EPHB6O15197 1021 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 MOCS3O95396 460 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRLRP16471 622 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF11P52732 1056 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 AMPD3Q01432 767 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 MYH10P35580 1976 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 VWA3BQ502W6 1294 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.59■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 TECP42680 631 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 CENPPQ6IPU0 288 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 RUBCNQ92622 972 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 EFCC1Q9HA90 598 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.58■□□□□ 0.89
RPS6KL1-209ENST00000555009 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSPY3P0CV98 308 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSPY8P0CW00 308 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 GPSM2P81274 684 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 NDST4Q9H3R1 872 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 DEF6Q9H4E7 631 aa20.58■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 LCA5LO95447 670 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 STX8Q9UNK0 236 aa20.57■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 AKR1B10O60218 316 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 NT5C2P49902 561 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 NAPAP54920 295 aa20.56■□□□□ 0.88
RPS6KL1-209ENST00000555009 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms