RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	NLRP10	Q86W26	655 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	LDHD	Q86WU2	507 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	LZTR1	Q8N653	840 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	MKL1	Q969V6	931 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	MMP19	Q99542	508 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	PIF1	Q9H611	641 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876		A0A1W2PQU0	124 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	NUAK1	O60285	661 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	ECI1	P42126	302 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	PPP2R2A	P63151	447 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	PRR5	P85299	388 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	NR1I3	Q14994	352 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	KCTD3	Q9Y597	815 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	EPN3	Q9H201	632 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	IRAK3	Q9Y616	596 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876		A0A1W2PQJ5	194 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876		F8W031	263 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	NPHS1	O60500	1241 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	FUCA1	P04066	466 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	LCP1	P13796	627 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	FPR2	P25090	351 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	HOXC12	P31275	282 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	MC3R	P41968	323 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	LIMS1	P48059	325 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	TESK1	Q15569	626 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876		Q8N1Y9	231 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	NTRK1	P04629	796 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	ATF2	P15336	505 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	FAM129C	Q86XR2	697 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	NETO2	Q8NC67	525 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	BTG4	Q9NY30	223 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	SNTG2	Q9NY99	539 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBM23-208	ENST00000553876	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	ASGR2	P07307	311 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	PML	P29590	882 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	KCNJ6	P48051	423 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	KCNAB2	Q13303	367 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	RASA3	Q14644	834 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	CABP7	Q86V35	215 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	IER2	Q9BTL4	223 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	RFXAP	O00287	272 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	PDPK1	O15530	556 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	DLX3	O60479	287 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	BCL6	P41182	706 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	DIO2	Q92813	273 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	TLDC2	A0PJX2	215 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	C22orf46	C9J442	243 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM13	O60858	407 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RBM23-208	ENST00000553876	LTBR	P36941	435 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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