RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	DIO2	Q92813	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	N4BP3	O15049	544 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	DLX3	O60479	287 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	FUCA1	P04066	466 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	FGFR1	P11362	822 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CDR1	P51861	262 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	LINC00310	P59036	64 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PRR5	P85299	388 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	FZD5	Q13467	585 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RASA3	Q14644	834 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	KCNA10	Q16322	511 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204		Q8N1Y9	231 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	C22orf46	C9J442	243 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PRODH	O43272	600 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ADCY3	O60266	1144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	NTRK1	P04629	796 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	LCP1	P13796	627 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	FBLN1	P23142	703 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	BCL6	P41182	706 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	GTF2A2	P52657	109 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	MYO1B	O43795	1136 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	FPR2	P25090	351 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	SSPN	Q14714	243 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	NTRK3	Q16288	839 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204		X6R8D5	127 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	CFP	P27918	469 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	CEP68	Q76N32	757 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	MKL1	Q969V6	931 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MDM2-233	ENST00000545204	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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