RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC2Q9BYS8 371 aa28.94■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 CTAGE5O15320 804 aa28.93■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 CABYRO75952 493 aa28.93■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 BEX3Q00994 111 aa28.93■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 TLE2Q04725 743 aa28.93■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 COL20A1Q9P218 1284 aa28.93■■■□□ 2.22
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TM7SF3-212ENST00000543088 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 DCDC2CA8MYV0 355 aa28.92■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 TTLL4Q14679 1199 aa28.92■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 STXBP2Q15833 593 aa28.92■■■□□ 2.22
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TM7SF3-212ENST00000543088 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.92■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 OPLAHO14841 1288 aa28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC34A2O95436 690 aa28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 CLTBP09497 229 aa28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 CPT1AP50416 773 aa28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 TOX2Q96NM4 488 aa28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 PXMP2Q9NR77 195 aa28.91■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 POLR2MP0CAP2 368 aa28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 RXRAP19793 462 aa28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 MICU3Q86XE3 530 aa28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 LTBP2Q14767 1821 aa28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.89■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.89■■■□□ 2.22
TM7SF3-212ENST00000543088 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 TXNP10599 105 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 HSPA4P34932 840 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 FGD1P98174 961 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 APOA5Q6Q788 366 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 TDHQ8IZJ6 230 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 FANCBQ8NB91 859 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 POLR3EQ9NVU0 708 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 ARVCFO00192 962 aa28.87■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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TM7SF3-212ENST00000543088 KCNB2Q92953 911 aa28.87■■■□□ 2.21
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TM7SF3-212ENST00000543088 SEPT14Q6ZU15 432 aa28.86■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 TMTC3Q6ZXV5 915 aa28.86■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.86■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 CUL5Q93034 780 aa28.86■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.86■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.86■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa28.86■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 ZBTB43O43298 467 aa28.85■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 CDK7P50613 346 aa28.85■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
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TM7SF3-212ENST00000543088 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.85■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.84■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 KIAA0355O15063 1070 aa28.84■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 RAG1P15918 1043 aa28.84■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 FAAP100Q0VG06 881 aa28.84■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.84■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.84■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
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TM7SF3-212ENST00000543088 PSMA5P28066 241 aa28.83■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 CCND2P30279 289 aa28.83■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 RCAN1P53805 252 aa28.83■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 ITGA7Q13683 1181 aa28.83■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 PGM5Q15124 567 aa28.83■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 RTN1Q16799 776 aa28.83■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.83■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
TM7SF3-212ENST00000543088 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.82■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 ARIH2O95376 493 aa28.82■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 GH1P01241 217 aa28.82■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 MYL3P08590 195 aa28.82■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.82■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.82■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 BADQ92934 168 aa28.82■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.82■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 GOLGA8AA7E2F4 631 aa28.81■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.81■■■□□ 2.2
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNV1Q6PIU1 500 aa28.81■■■□□ 2.2
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