RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	CYBA	P13498	195 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	HSD17B4	P51659	736 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	SMCO2	A6NFE2	343 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	POLR2M	P0CAP2	368 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	SMARCA1	P28370	1054 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	ARMC5	Q96C12	935 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	IGHA2	P01877	340 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PRMT2	P55345	433 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PGK1	P00558	417 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	NPY5R	Q15761	445 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	OXER1	Q8TDS5	423 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	COPS5	Q92905	334 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	KATNBL1	Q9H079	304 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	ARIH2	O95376	493 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	DEXI	O95424	95 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	ADCY7	P51828	1080 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PGM5	Q15124	567 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PPP2R5B	Q15173	497 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	CUL5	Q93034	780 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	ALG1	Q9BT22	464 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	MYADML2	A6NDP7	307 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	RGS20	O76081	388 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	NR5A1	Q13285	461 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	ACVR2B	Q13705	512 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-222	ENST00000539477	NR3C2	P08235	984 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	NLRP5	P59047	1200 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PDE4D	Q08499	809 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		10.65	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	KAT6A	Q92794	2004 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	CDKL5	O76039	1030 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	LY6K	Q17RY6	165 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ANO3	Q9BYT9	981 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	EDNRB	P24530	442 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	LHX8	Q68G74	356 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	GJA10	Q969M2	543 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	COL6A3	P12111	3177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	STK36	Q9NRP7	1315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SEPT4	O43236	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SMPD1	P17405	629 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	GJB2	P29033	226 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	BEX3	Q00994	111 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	SP4	Q02446	784 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	DNER	Q8NFT8	737 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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