RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 USP28Q96RU2 1077 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PORCNQ9H237 461 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 EFCC1Q9HA90 598 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CNPY2Q9Y2B0 182 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 RPTORQ8N122 1335 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PLXNB2O15031 1838 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 POTEB2H3BUK9 544 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 FIBPO43427 364 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CYP3A4P08684 503 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 HTRA3P83110 453 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 JMYQ8N9B5 988 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 RMDN3Q96TC7 470 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PXMP2Q9NR77 195 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 COL20A1Q9P218 1284 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 MYH7BA7E2Y1 1941 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ZNF236Q9UL36 1845 aa13.62□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 TCHHQ07283 1943 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 B4DLN1 442 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 LAD1O00515 517 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PTMSP20962 102 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 MCM7P33993 719 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 NBR1Q14596 966 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ARHGEF16Q5VV41 709 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 XRRA1Q6P2D8 792 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 GPR142Q7Z601 462 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CRYGNQ8WXF5 182 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 TAAR1Q96RJ0 339 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CLIC4Q9Y696 253 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ELP1O95163 1332 aa13.61□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 NEMFO60524 1076 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PPP6R2O75170 966 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CYP3A7P24462 503 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CCND2P30279 289 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CIITAP33076 1130 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ZNF76P36508 570 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SLC39A14Q15043 492 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ZNF174Q15697 407 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PCNX4Q63HM2 1172 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 FAM133AQ8N9E0 248 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 TMEM87AQ8NBN3 555 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CHAMP1Q96JM3 812 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 IWS1Q96ST2 819 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PDCD2LQ9BRP1 358 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 LCTP09848 1927 aa13.6□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SLC15A5A6NIM6 579 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SPTLC2O15270 562 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 STAM2O75886 525 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PTPREP23469 700 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ADORA2AP29274 412 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 MCM4P33991 863 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 GRB14Q14449 540 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PGM5Q15124 567 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PTPAQ15257 358 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 RNF186Q9NXI6 227 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.59□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 WNT7AO00755 349 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 TRPA1O75762 1119 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 TDP2O95551 362 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 NR3C2P08235 984 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 FCGRTP55899 365 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 UBXN2AP68543 259 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 CNTN2Q02246 1040 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 PTGDRQ13258 359 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 KIF22Q14807 665 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 Q4G0T1 1027 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 NIPA1Q7RTP0 329 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 SOCS4Q8WXH5 440 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 FERMT2Q96AC1 680 aa13.58□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MBOAT7Q96N66 472 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms