RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536420.5

ACVR1B-204, Transcript of activin A receptor type 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ACVR1B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1B-204ENST00000536420 TXNP10599 105 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 PBX2P40425 430 aa28.19■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 TTLL4Q14679 1199 aa28.19■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 USH1GQ495M9 461 aa28.19■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 MCF2L2Q86YR7 1114 aa28.19■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.19■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.19■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 VCANP13611 3396 aa28.19■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.18■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.18■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 GBF1Q92538 1859 aa28.18■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.17■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 ADGRF4Q8IZF3 695 aa28.17■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 IWS1Q96ST2 819 aa28.17■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC28A3Q9HAS3 691 aa28.17■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.17■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa28.16■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 B4E1Z4 1266 aa28.16■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.15■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 PITPNM1O00562 1244 aa28.14■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 RFC2P35250 354 aa28.14■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 SCLYQ96I15 445 aa28.14■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 UBAC1Q9BSL1 405 aa28.14■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 CPVLQ9H3G5 476 aa28.14■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.14■■■□□ 2.1
ACVR1B-204ENST00000536420 CYP2C9P11712 490 aa28.13■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 ACTN1P12814 892 aa28.13■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 STXBP2Q15833 593 aa28.13■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.13■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.13■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 FBXO11Q86XK2 927 aa28.13■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.13■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 QRICH1Q2TAL8 776 aa28.12■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 RETREG2Q8NC44 543 aa28.12■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.12■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 COPS5Q92905 334 aa28.12■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa28.12■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 GH1P01241 217 aa28.11■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 BFSP2Q13515 415 aa28.11■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 TBC1D5Q92609 795 aa28.11■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 TAAR1Q96RJ0 339 aa28.11■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 RMDN3Q96TC7 470 aa28.11■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa28.11■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 SCN5AQ14524 2016 aa28.1■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 ZBBXA8MT70 800 aa28.1■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 VWCEQ96DN2 955 aa28.1■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 AMNQ9BXJ7 453 aa28.1■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 JMJD4Q9H9V9 463 aa28.1■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 NOD1Q9Y239 953 aa28.1■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 ARIH2O95376 493 aa28.09■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 TRAF1Q13077 416 aa28.09■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.09■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 SAMD3Q8N6K7 520 aa28.09■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.09■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 VAT1LQ9HCJ6 419 aa28.09■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 TTC28Q96AY4 2481 aa28.08■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGEF16Q5VV41 709 aa28.08■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 SEPT14Q6ZU15 432 aa28.08■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 USP38Q8NB14 1042 aa28.08■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
ACVR1B-204ENST00000536420 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.07■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 IQCF3P0C7M6 154 aa28.07■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 GHRHRQ02643 423 aa28.07■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 TRDNQ13061 729 aa28.07■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.07■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 SESTD1Q86VW0 696 aa28.07■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28.07■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 AFG1LQ8WV93 481 aa28.07■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 COL20A1Q9P218 1284 aa28.07■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 MMP3P08254 477 aa28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 ARHGAP1Q07960 439 aa28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 LY6KQ17RY6 165 aa28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 PPP2R2DQ66LE6 453 aa28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 CAGE1Q8TC20 777 aa28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC9A7Q96T83 725 aa28.06■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 KLRF2D3W0D1 207 aa28.05■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 CFBP00751 764 aa28.05■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 HSD17B4P51659 736 aa28.05■■■□□ 2.08
ACVR1B-204ENST00000536420 SEC23AQ15436 765 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms