RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GPR27Q9NS67 375 aa10.72□□□□□ -0.69
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.71□□□□□ -0.69
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 LZTR1Q8N653 840 aa10.68□□□□□ -0.7
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 MTA3Q9BTC8 594 aa10.65□□□□□ -0.7
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRAF6Q9Y4K3 522 aa10.64□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MSCO60682 206 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 APPP05067 770 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ERVFRD-1P60508 538 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KIZQ2M2Z5 673 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRIM61Q5EBN2 209 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MPZL3Q6UWV2 235 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LBX2Q6XYB7 198 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IRF2BP1Q8IU81 584 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TEX2Q8IWB9 1127 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM169Q96HH4 297 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ASXL2Q76L83 1435 aa10.63□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SOGA1O94964 1423 aa10.62□□□□□ -0.71
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GMDS-AS1-212ENST00000534160 H7BY64 318 aa10.62□□□□□ -0.71
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MPOP05164 745 aa10.62□□□□□ -0.71
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