RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-215	ENST00000533872	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RPS2-215	ENST00000533872	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RPS2-215	ENST00000533872	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RPS2-215	ENST00000533872	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
RPS2-215	ENST00000533872	ADCY7	P51828	1080 aa		28.2	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	PXMP2	Q9NR77	195 aa		28.2	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	TRPV1	Q8NER1	839 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	WASF1	Q92558	559 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	SHISA4	Q96DD7	197 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	IWS1	Q96ST2	819 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	KATNBL1	Q9H079	304 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	28.19	■■■□□ 2.1	not detected	■■■■■ 33.6
RPS2-215	ENST00000533872	RNF208	Q9H0X6	261 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	JAK2	O60674	1132 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	C6orf50	Q9HD87	102 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	GNA11	P29992	359 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	PDE4D	Q08499	809 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	ACVR2B	Q13705	512 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	UBE2S	Q16763	222 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	AIFM3	Q96NN9	605 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	DTNB	O60941	627 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	VTA1	Q9NP79	307 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	SEPT4	O43236	478 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	GJB1	P08034	283 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	XBP1	P17861	261 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	PGM5	Q15124	567 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	BICD2	Q8TD16	824 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	ALG1	Q9BT22	464 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	MSC	O60682	206 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	NR3C2	P08235	984 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	CNGA1	P29973	690 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	AP3B2	Q13367	1082 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	AKR1A1	P14550	325 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	NLRP5	P59047	1200 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	STXBP2	Q15833	593 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	MCTP2	Q6DN12	878 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	GALNT17	Q6IS24	598 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	IL31RA	Q8NI17	732 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	SNX21	Q969T3	373 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	DEFB118	Q96PH6	123 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	CCND2	P30279	289 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	ANO3	Q9BYT9	981 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	SGPL1	O95470	568 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	CAPN2	P17655	700 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	GJA8	P48165	433 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	NPY5R	Q15761	445 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	LHX8	Q68G74	356 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	TMEM260	Q9NX78	707 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	ADAMTS3	O15072	1205 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	STAM2	O75886	525 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	CUL4A	Q13619	759 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	POTEF	A5A3E0	1075 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS2-215	ENST00000533872	BLID	Q8IZY5	108 aa		28.08	■■■□□ 2.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms