RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533025.1

YPEL4-208, Transcript of yippee like 4, human

TSL 4

Gene YPEL4, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
YPEL4-208	ENST00000533025	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	ACLY	P53396	1101 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	RCAN1	P53805	252 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	STXBP2	Q15833	593 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025		Q9Y3F1	56 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025		A0A1W2PQY0	241 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	ASGR1	P07306	291 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	RTP1	P59025	263 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	NKX3-2	P78367	333 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	ZEB2	O60315	1214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	NR3C2	P08235	984 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	SYN1	P17600	705 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PTGS1	P23219	599 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	CDC27	P30260	824 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	BEX3	Q00994	111 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	CUL5	Q93034	780 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	CTAGE5	O15320	804 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	SNX17	Q15036	470 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PGM5	Q15124	567 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	ELP1	O95163	1332 aa		13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	FUT2	Q10981	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
YPEL4-208	ENST00000533025	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	MEIS2	O14770	477 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	CABYR	O75952	493 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	CCND2	P30279	289 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	CPT1A	P50416	773 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	EVC	P57679	992 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	COPS5	Q92905	334 aa		13.7	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.69	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.69	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	ARIH2	O95376	493 aa		13.69	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	NAPA	P54920	295 aa		13.69	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	ANAPC15	P60006	121 aa		13.69	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	TLE2	Q04725	743 aa		13.69	□□□□□ -0.22
YPEL4-208	ENST00000533025	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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