RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 RETREG2Q8NC44 543 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 LPAR1Q92633 364 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MAP7D2Q96T17 732 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MXD3Q9BW11 206 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TRIM9Q9C026 710 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 USP17L10C9JJH3 530 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 PSMD14O00487 310 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 ZSCAN12O43309 604 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 EDIL3O43854 480 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 DPEP1P16444 411 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 CCNE1P24864 410 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 CAP2P40123 477 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 STAT2P52630 851 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 LRRC63Q05C16 580 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 EHHADHQ08426 723 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 FIGNQ5HY92 759 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 SV2BQ7L1I2 683 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 TMC6Q7Z403 805 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 CNGA4Q8IV77 575 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 JDP2Q8WYK2 163 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 MED15Q96RN5 788 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 NUP58Q9BVL2 599 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 VCPKMTQ9H867 229 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 34.2
PACS1-211ENST00000531298 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 FEM1BQ9UK73 627 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 CNTNAP1P78357 1384 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 EP400Q96L91 3159 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 MEIS2O14770 477 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 ADAMTS3O15072 1205 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 TPM1P09493 284 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 ATP1A3P13637 1013 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 PLCG1P19174 1290 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 AFMP43652 599 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 CENPPQ6IPU0 288 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 ERMNQ8TAM6 284 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 RAD54LQ92698 747 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 COA7Q96BR5 231 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 ANO3Q9BYT9 981 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 COL4A5P29400 1685 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 GH2P01242 217 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 BCRP11274 1271 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 RPA1P27694 616 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 PRCPP42785 496 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 DNM2P50570 870 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 TUBB4BP68371 445 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 CXCL9Q07325 125 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 TCP10Q12799 353 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 LRMPQ12912 555 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 GRB10Q13322 594 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 TUBB2AQ13885 445 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 PTPN14Q15678 1187 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PACS1-211ENST00000531298 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.44□□□□□ -1.06
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