RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525809.5

BBS1-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 601 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D5	Q92609	795 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	TNKS	O95271	1327 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	PARP14	Q460N5	1801 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	PFKM	P08237	780 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	STXBP2	Q15833	593 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	COPS5	Q92905	334 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	RMDN3	Q96TC7	470 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-208	ENST00000525809	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	GH1	P01241	217 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CYP2C9	P11712	490 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	RFC2	P35250	354 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	TRDN	Q13061	729 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	BFSP2	Q13515	415 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SCLY	Q96I15	445 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	AMN	Q9BXJ7	453 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	KLRF2	D3W0D1	207 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ARIH2	O95376	493 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ACTN1	P12814	892 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	TRAF1	Q13077	416 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	AFG1L	Q8WV93	481 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	NOD1	Q9Y239	953 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ZBBX	A8MT70	800 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CFB	P00751	764 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	NR3C2	P08235	984 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	IQCF3	P0C7M6	154 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	LAMC2	Q13753	1193 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SEC23A	Q15436	765 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	LY6K	Q17RY6	165 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	TTC22	Q5TAA0	569 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	VWCE	Q96DN2	955 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	MTMR8	Q96EF0	704 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	COL20A1	Q9P218	1284 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	LTBP2	Q14767	1821 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ERICH2	A1L162	156 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ZBTB5	O15062	677 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PDE4A	P27815	886 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	HSD17B4	P51659	736 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CHMP4BP1	P59074	171 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	GHRHR	Q02643	423 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	ARHGAP1	Q07960	439 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PTGIS	Q16647	500 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	DGKD	Q16760	1214 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	SESTD1	Q86VW0	696 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PXMP2	Q9NR77	195 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	MYH4	Q9Y623	1939 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	MMP3	P08254	477 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	IGFBP4	P22692	258 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	CHML	P26374	656 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	RABGGTB	P53611	331 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-208	ENST00000525809	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49

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