RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521038.5

PHF20L1-217, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 427 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-217	ENST00000521038	STK26	Q9P289	416 aa		6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	NEDD4	P46934	1319 aa		6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	STK36	Q9NRP7	1315 aa		6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		6.48	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	AGL	P35573	1532 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A1W2PQJ5	194 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CPLX1	O14810	134 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PPIP5K2	O43314	1243 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	E2F6	O75461	281 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TAF5L	O75529	589 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRIM37	O94972	964 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ANP32D	O95626	131 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	BMP1	P13497	986 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATP1A3	P13637	1013 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	RXRB	P28702	533 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ACADVL	P49748	655 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PDE6C	P51160	858 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PPP2R2A	P63151	447 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	MXRA7	P84157	204 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PTH1R	Q03431	593 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PSMD2	Q13200	908 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PPP2R5B	Q15173	497 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PPP1R7	Q15435	360 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	IRGC	Q6NXR0	463 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	UNC13D	Q70J99	1090 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCDC80	Q76M96	950 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	AFAP1	Q8N556	730 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATL2	Q8NHH9	583 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	DNAJC7	Q99615	494 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	USP44	Q9H0E7	712 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	EXOC1	Q9NV70	894 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SCOC	Q9UIL1	159 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	SNX12	Q9UMY4	172 aa		6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		6.46	□□□□□ -1.37
PHF20L1-217	ENST00000521038	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038		H7C1D1	291 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCDC188	H7C350	402 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	ORC4	O43929	436 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	SKI	P12755	728 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	IDE	P14735	1019 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATP4A	P20648	1035 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	ATP6V1C1	P21283	382 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	GSK3A	P49840	483 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	DNM2	P50570	870 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	MYO1E	Q12965	1108 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	PDCL	Q13371	301 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	CUL4B	Q13620	913 aa		6.46	□□□□□ -1.38
PHF20L1-217	ENST00000521038	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38

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