RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 VAT1LQ9HCJ6 419 aa19.78■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 ABCB11O95342 1321 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 RAD50Q92878 1312 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 CDH23Q9H251 3354 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 A6NJR5 290 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 ARIH2O95376 493 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 QRICH1Q2TAL8 776 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 NBPF20Q3BBV1 942 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 FAM47CQ5HY64 1035 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 TAAR1Q96RJ0 339 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 JMJD4Q9H9V9 463 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 COL20A1Q9P218 1284 aa19.77■□□□□ 0.76
HERC3-211ENST00000513325 EYSQ5T1H1 3165 aa19.77■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 KPNA6O60684 536 aa19.76■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 TTLL4Q14679 1199 aa19.76■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 VWCEQ96DN2 955 aa19.76■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 UBAC1Q9BSL1 405 aa19.76■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 CNNM2Q9H8M5 875 aa19.76■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 MSRAQ9UJ68 235 aa19.76■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 PDE4AP27815 886 aa19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 RAB30Q15771 203 aa19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 CCDC62Q6P9F0 684 aa19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 FBXO11Q86XK2 927 aa19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 MCF2L2Q86YR7 1114 aa19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 MAF1Q9H063 256 aa19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 PRDM12Q9H4Q4 367 aa19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 STAG2Q8N3U4 1231 aa19.74■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 USP38Q8NB14 1042 aa19.74■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 RMDN3Q96TC7 470 aa19.74■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa19.74■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa19.74■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 LY6KQ17RY6 165 aa19.73■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 TTC22Q5TAA0 569 aa19.73■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 NFRKBQ6P4R8 1299 aa19.73■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 CYB5R4Q7L1T6 521 aa19.73■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 AFG1LQ8WV93 481 aa19.73■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa19.73■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 CUL9Q8IWT3 2517 aa19.73■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 ZBBXA8MT70 800 aa19.72■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 RABGGTBP53611 331 aa19.72■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 CHMP4BP1P59074 171 aa19.72■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 SEC23AQ15436 765 aa19.72■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 STXBP2Q15833 593 aa19.72■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 DEFB128Q7Z7B8 93 aa19.72■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 IWS1Q96ST2 819 aa19.72■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 SLC28A3Q9HAS3 691 aa19.72■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 CFBP00751 764 aa19.71■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 GH1P01241 217 aa19.71■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 PFKMP08237 780 aa19.71■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP1Q07960 439 aa19.71■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF16Q5VV41 709 aa19.71■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 CHST3Q7LGC8 479 aa19.71■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 AMNQ9BXJ7 453 aa19.71■□□□□ 0.75
HERC3-211ENST00000513325 KLRF2D3W0D1 207 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 MMP3P08254 477 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 MYOGP15173 224 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 RETREG2Q8NC44 543 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PPM1EQ8WY54 764 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 MAD2L2Q9UI95 211 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 NOD1Q9Y239 953 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa19.7■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PITPNM1O00562 1244 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 OPLAHO14841 1288 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 NR3C2P08235 984 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 IQCF3P0C7M6 154 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PTH1RQ03431 593 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 TRDNQ13061 729 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 ADGRE1Q14246 886 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 MTMR8Q96EF0 704 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PXMP2Q9NR77 195 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 GBF1Q92538 1859 aa19.69■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 MYH6P13533 1939 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB5O15062 677 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 CYP21A2P08686 494 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 CASTP20810 708 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 RFC2P35250 354 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 HSD17B4P51659 736 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-211ENST00000513325 BFSP2Q13515 415 aa19.68■□□□□ 0.74
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