RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 HMX2A2RU54 273 aa2.85□□□□□ -1.95
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PDE4D-218ENST00000509368 FOSP01100 380 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 NFICP08651 508 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 COL6A1P12109 1028 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 GJA9P57773 515 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 CDK5R2Q13319 367 aa2.85□□□□□ -1.95
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 C11orf74Q86VG3 221 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ISL2Q96A47 359 aa2.85□□□□□ -1.95
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PDE4D-218ENST00000509368 YIPF4Q9BSR8 244 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 NDOR1Q9UHB4 597 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ERCC6L2Q5T890 1561 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
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PDE4D-218ENST00000509368 CBX4O00257 560 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 CBFA2T2O43439 604 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ADMP35318 185 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ETV3P41162 512 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SYCP2LQ5T4T6 812 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZS46 218 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 CDC37L1Q7L3B6 337 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM130Q8N3G9 435 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 VWCEQ96DN2 955 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 FOXQ1Q9C009 403 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 RNF208Q9H0X6 261 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SUGCTQ9HAC7 445 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf112Q9NSG2 853 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 USP25Q9UHP3 1055 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 WNT9AO14904 365 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 GSTA4O15217 222 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 HRGP04196 525 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 RBP3P10745 1247 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 BMP3P12645 472 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 MAN1A1P33908 653 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 GPR85P60893 370 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 GPR158Q5T848 1215 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 IQCEQ6IPM2 695 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TXNRD3Q86VQ6 643 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 RNF141Q8WVD5 230 aa2.84□□□□□ -1.95
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PDE4D-218ENST00000509368 RAD18Q9NS91 495 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 B4GALT6Q9UBX8 382 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 CEP131Q9UPN4 1083 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-218ENST00000509368 TNKSO95271 1327 aa2.84□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 WASHC2AQ641Q2 1341 aa2.84□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 ARVCFO00192 962 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 NEMP1O14524 444 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 GAS7O60861 476 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 LRIG2O94898 1065 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 JMJD7P0C870 316 aa2.83□□□□□ -1.96
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PDE4D-218ENST00000509368 LRRC41Q15345 812 aa2.83□□□□□ -1.96
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PDE4D-218ENST00000509368 KSR2Q6VAB6 950 aa2.83□□□□□ -1.96
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PDE4D-218ENST00000509368 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa2.83□□□□□ -1.96
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PDE4D-218ENST00000509368 SMC1BQ8NDV3 1235 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM86C1Q9NVL1 165 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 PGAP2Q9UHJ9 254 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa2.83□□□□□ -1.96
PDE4D-218ENST00000509368 TOPBP1Q92547 1522 aa2.83□□□□□ -1.96
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