RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 EDNRBP24530 442 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP2R5BQ15173 497 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 ADCY6O43306 1168 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 RPS6KB1P23443 525 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 GHRHRQ02643 423 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 TTLL4Q14679 1199 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 PXMP2Q9NR77 195 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
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SH3BP2-210ENST00000505941 ASGR1P07306 291 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 CPA1P15085 419 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 RCAN1P53805 252 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 COL20A1Q9P218 1284 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-210ENST00000505941 CABYRO75952 493 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 NR3C2P08235 984 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 SYN1P17600 705 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 NKX3-2P78367 333 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 BRF1Q92994 677 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 ELP1O95163 1332 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 LCTP09848 1927 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 MYADML2A6NDP7 307 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 OPLAHO14841 1288 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 CPT1AP50416 773 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 BEX3Q00994 111 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM60Q495X7 471 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 RUFY3Q7L099 469 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 APOBRQ0VD83 1088 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX17Q15036 470 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXL16Q8N461 479 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 ALPK3Q96L96 1907 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 CCND2P30279 289 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 TLE2Q04725 743 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP290O15078 2479 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 KPNA6O60684 536 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 PGM5Q15124 567 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-210ENST00000505941 PIK3CDO00329 1044 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 CTAGE5O15320 804 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 GH1P01241 217 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 TOX2Q96NM4 488 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 ARVCFO00192 962 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 STAM2O75886 525 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 MYL3P08590 195 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 CLTBP09497 229 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 NAPAP54920 295 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 GNPTABQ3T906 1256 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
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