RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	FCER1A	P12319	257 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	KCTD2	Q14681	263 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	NEK8	Q86SG6	692 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	MMP19	Q99542	508 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	EFCC1	Q9HA90	598 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	ATP2B1	P20020	1258 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	SREBF1	P36956	1147 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	COL20A1	Q9P218	1284 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	STRN	O43815	780 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	TTC38	Q5R3I4	469 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	RNF186	Q9NXI6	227 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	LCT	P09848	1927 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	TRPA1	O75762	1119 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	USP28	Q96RU2	1077 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	USP11	P51784	963 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	SOX10	P56693	466 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGAP4	P98171	946 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	ANO1	Q5XXA6	986 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	RMDN3	Q96TC7	470 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	POTEB2	H3BUK9	544 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	LETM2	Q2VYF4	491 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	MGAM	O43451	1857 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	RPTOR	Q8N122	1335 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		32.45	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		32.45	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		32.45	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	BMP15	O95972	392 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	NBR1	Q14596	966 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	GPR142	Q7Z601	462 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	DNER	Q8NFT8	737 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PXMP2	Q9NR77	195 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	CLIC4	Q9Y696	253 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	CYP3A4	P08684	503 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	32.43	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	YEATS4	O95619	227 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	TBC1D8	O95759	1140 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PTPRE	P23469	700 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	MCM7	P33993	719 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	STK38	Q15208	465 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF174	Q15697	407 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	FIBP	O43427	364 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF76	P36508	570 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	CNTN2	Q02246	1040 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	SPATA32	Q96LK8	384 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842		B4DLN1	442 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	WNT7A	O00755	349 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	UBXN2A	P68543	259 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PGK2	P07205	417 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	ADORA2A	P29274	412 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	GRB14	Q14449	540 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PGM5	Q15124	567 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	IWS1	Q96ST2	819 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC19-208	ENST00000497842	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	CYP3A7	P24462	503 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TTC19-208	ENST00000497842	CCND2	P30279	289 aa		32.38	■■■□□ 2.77

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