RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 RASA2Q15283 850 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM83AQ86UY5 434 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 WRNIP1Q96S55 665 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRCP08575 1304 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SEMA3EO15041 775 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CPP00450 1065 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GCKP35557 465 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 POU5F1BQ06416 359 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIL2Q13356 520 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC31Q6UY01 552 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC49Q8IUZ0 686 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPIRE2Q8WWL2 714 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC4Q96A65 974 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf74Q96LT6 269 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CNPY2Q9Y2B0 182 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 AKR1B10O60218 316 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GBP6Q6ZN66 633 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TMC6Q7Z403 805 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM76AQ8TAV0 307 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MIPOL1Q8TD10 442 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 USP6NLQ92738 828 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CORO1BQ9BR76 489 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MRIQ9BWK5 157 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF3C4Q9UKN8 822 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PRELID1Q9Y255 219 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 OSBPP22059 807 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PPATQ06203 517 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CRHR2Q13324 411 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 NEDD9Q14511 834 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX21Q969T3 373 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ARMC5Q96C12 935 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MXD3Q9BW11 206 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 OAS2P29728 719 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 HSD17B7P56937 341 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC158Q5M9N0 1113 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 IRGCQ6NXR0 463 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CHPFQ8IZ52 775 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPYL6Q8N831 410 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 NEK11Q8NG66 645 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SUN5Q8TC36 379 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 LPIN2Q92539 896 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.591e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-213ENST00000496055 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 COL4A5P29400 1685 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDYE5A6NIY4 337 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CXCL11O14625 94 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SCG2P13521 617 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PLCG2P16885 1265 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 HALP42357 657 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GYG1P46976 350 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SCNN1BP51168 640 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PAK2Q13177 524 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MVPQ14764 893 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MUM1Q2TAK8 710 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPECC1Q5M775 1068 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 DLK2Q6UY11 383 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.11□□□□□ -1.59
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RABGGTB-213ENST00000496055 BICD2Q8TD16 824 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 RABGGTAQ92696 567 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PSD3Q9NYI0 1048 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 POLG2Q9UHN1 485 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 JAG2Q9Y219 1238 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 OPA1O60313 960 aa5.11□□□□□ -1.59
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