RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492283.1

RBMS1-215, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 5

Gene RBMS1, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-215	ENST00000492283	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MCM5	P33992	734 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	ACLY	P53396	1101 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	COG5	Q9UP83	839 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF536	O15090	1300 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	PYGB	P11216	843 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CDK7	P50613	346 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	SEC23A	Q15436	765 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	PRC1	O43663	620 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	NHLH1	Q02575	133 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	USH1G	Q495M9	461 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	ASB14	A6NK59	587 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	REC8	O95072	547 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	FGB	P02675	491 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	RABGGTB	P53611	331 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	KRT32	Q14532	448 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBMS1-215	ENST00000492283		B4DLN1	442 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	AKR1A1	P14550	325 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	MYOG	P15173	224 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	CALML3	P27482	149 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	FGD1	P98174	961 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	TRAF1	Q13077	416 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	KCNA10	Q16322	511 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	HLA-C	Q95604	372 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	ELP1	O95163	1332 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	RFXAP	O00287	272 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	KIF5B	P33176	963 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	GRM4	Q14833	912 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBMS1-215	ENST00000492283	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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