RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PQ27 194 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PQ64 194 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PQC6 194 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PQD8 194 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PLD2O14939 933 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 NPHS1O60500 1241 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.655e-13■□□□□ 9
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKCAP17252 672 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 TACR1P25103 407 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GABREP78334 506 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 MVKQ03426 396 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRX1Q86UT6 975 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRP10Q86W26 655 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 LILRA2Q8N149 483 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 DPF3Q92784 378 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF32Q9H0A6 362 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR27Q9NS67 375 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 MYO1BO43795 1136 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 RASGRP1O95267 797 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 BCL6P41182 706 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 AFMP43652 599 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR85P60893 370 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 BRAPQ7Z569 592 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 FGD2Q7Z6J4 655 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ABHD4Q8TB40 342 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SHISA4Q96DD7 197 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ASIC4Q96FT7 647 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 KIRREL1Q96J84 757 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 FEZ1Q99689 392 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF114Q9Y508 228 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 AQP7O14520 342 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 EFCAB14O75071 495 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 CRTAMO95727 393 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 FUCA1P04066 466 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SDSP20132 328 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 FPR2P25090 351 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 CORO7P57737 925 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 LBX2Q6XYB7 198 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SCLYQ96I15 445 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 MTA3Q9BTC8 594 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 RFPL3O75679 317 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PAPLNO95428 1278 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SDHBP21912 280 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GTF2A2P52657 109 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GYS2P54840 703 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP4F8P98187 520 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 GUCY1A3Q02108 690 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 LSAMPQ13449 338 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP68Q76N32 757 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 LZTR1Q8N653 840 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 USP33Q8TEY7 942 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 NINJ1Q92982 152 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 CLDND1Q9NY35 253 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 NCAPD3P42695 1498 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PQJ5 194 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 C22orf46C9J442 243 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNQ2O43526 872 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 CLSTN1O94985 981 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-211ENST00000489450 SOD2P04179 222 aa4.73□□□□□ -1.65
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