RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 ADCY6O43306 1168 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 RARBP10826 455 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 SCG2P13521 617 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 NAPAP54920 295 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 SCRN1Q12765 414 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 CUL5Q93034 780 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 IWS1Q96ST2 819 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 BARHL2Q9NY43 387 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PFKFB2O60825 505 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PPFIA3O75145 1194 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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PTPRN-216ENST00000486480 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 MEIS2O14770 477 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 LARGE1O95461 756 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.02■■□□□ 1.12
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PTPRN-216ENST00000486480 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 BACH2Q9BYV9 841 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-216ENST00000486480 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 TNFAIP2Q03169 654 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 ME3Q16798 604 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 IL31RAQ8NI17 732 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 ALPK3Q96L96 1907 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 DNM1LO00429 736 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 NR3C2P08235 984 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 ADCY7P51828 1080 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 PGM5Q15124 567 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 RABEP1Q15276 862 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 STXBP2Q15833 593 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 UBE2SQ16763 222 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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PTPRN-216ENST00000486480 ADAMTS4O75173 837 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 CDKL5O76039 1030 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRN-216ENST00000486480 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 NECAB1Q8N987 351 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 GTF3C6Q969F1 213 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 ESYT2A0FGR8 921 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 SMCO2A6NFE2 343 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRN-216ENST00000486480 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 SMPD1P17405 629 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 CCND2P30279 289 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 LRRC41Q15345 812 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 SCFD2Q8WU76 684 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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PTPRN-216ENST00000486480 KBTBD13C9JR72 458 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRN-216ENST00000486480 DEXIO95424 95 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 COL6A1P12109 1028 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRN-216ENST00000486480 RNF180Q86T96 592 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 TLK2Q86UE8 772 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 STK36Q9NRP7 1315 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 CTDNEP1O95476 244 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 PTGS1P23219 599 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 GJA9P57773 515 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-216ENST00000486480 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.96■■□□□ 1.11
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