RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 CPP00450 1065 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 NTRK1P04629 796 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 LIMS1P48059 325 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 DDR2Q16832 855 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM129CQ86XR2 697 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 DIO2Q92813 273 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 MTA3Q9BTC8 594 aa6.65□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 INF2Q27J81 1249 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGGTB-210ENST00000485459 C22orf46C9J442 243 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 NCAM1P13591 858 aa6.63□□□□□ -1.35
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RABGGTB-210ENST00000485459 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.63□□□□□ -1.35
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RABGGTB-210ENST00000485459 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF38Q9H0F5 515 aa6.63□□□□□ -1.35
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RABGGTB-210ENST00000485459 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 KLF4O43474 513 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB7AO95365 584 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 ASGR2P07307 311 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 INHBBP09529 407 aa6.62□□□□□ -1.35
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RABGGTB-210ENST00000485459 DPF3Q92784 378 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 SCG5P05408 212 aa6.61□□□□□ -1.35
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RABGGTB-210ENST00000485459 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PQU0 124 aa6.6□□□□□ -1.35
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RABGGTB-210ENST00000485459 ATF2P15336 505 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 FBLN1P23142 703 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 BCL6P41182 706 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-210ENST00000485459 GRIA2P42262 883 aa6.6□□□□□ -1.35
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RABGGTB-210ENST00000485459 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.59□□□□□ -1.35
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RABGGTB-210ENST00000485459 USP53Q70EK8 1073 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SEC14L1Q92503 715 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX11Q96FC9 970 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 SGSM3Q96HU1 749 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-210ENST00000485459 CLDND1Q9NY35 253 aa6.58□□□□□ -1.36
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