RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.357e-13■■■■□ 19.9
ACTB-212ENST00000484841 TIFAQ96CG3 184 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 AMNQ9BXJ7 453 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 STXBP2Q15833 593 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 IWS1Q96ST2 819 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 RMDN3Q96TC7 470 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 KLRF2D3W0D1 207 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 CFBP00751 764 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 CHMP4BP1P59074 171 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 TRAF1Q13077 416 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 ZNF576Q9H609 170 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 MSRAQ9UJ68 235 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.45■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 HERVK_113Q902F9 699 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D5Q92609 795 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 COPS5Q92905 334 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 IL25Q9H293 177 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 NOD1Q9Y239 953 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 A6NJR5 290 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 GH1P01241 217 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 CHMLP26374 656 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 SEC23AQ15436 765 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 RAB30Q15771 203 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 NCOA7Q8NI08 942 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 RETREG2Q8NC44 543 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 PBX4Q9BYU1 374 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB5O15062 677 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 PFKMP08237 780 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 CYP21A2P08686 494 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 CYP2C9P11712 490 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 WTAPQ15007 396 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 RASIP1Q5U651 963 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 CHST3Q7LGC8 479 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 HOMER1Q86YM7 354 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 SCLYQ96I15 445 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 ZBBXA8MT70 800 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 ARIH2O95376 493 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 PTH1RQ03431 593 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 GRIN2CQ14957 1233 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 LY6KQ17RY6 165 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 COL20A1Q9P218 1284 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 ACTN1P12814 892 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 BFSP2Q13515 415 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 GRM4Q14833 912 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 AFG1LQ8WV93 481 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 PXMP2Q9NR77 195 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 COL6A3P12111 3177 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-212ENST00000484841 E7EWF7 191 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 NR3C2P08235 984 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 PBX2P40425 430 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 GBF1Q92538 1859 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 SGSM2O43147 1006 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 MMP3P08254 477 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 RFC2P35250 354 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 HSD17B4P51659 736 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-212ENST00000484841 DGKDQ16760 1214 aa23.38■■□□□ 1.33
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