RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 RUFY3Q7L099 469 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 KLHDC9Q8NEP7 349 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 CUL5Q93034 780 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 ELP1O95163 1332 aa15.41■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 TTLL4Q14679 1199 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 GNASQ5JWF2 1037 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZUG5 572 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 TLK2Q86UE8 772 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 TAAR1Q96RJ0 339 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 WDR11Q9BZH6 1224 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 PXMP2Q9NR77 195 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.4■□□□□ 0.06
PRAME-211ENST00000476336 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PIK3CDO00329 1044 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 OPLAHO14841 1288 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 STAM2O75886 525 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 ADCYAP1R1P41586 468 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 ACLYP53396 1101 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 EVCP57679 992 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 SNX17Q15036 470 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 BRF1Q92994 677 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 TCEANC2Q96MN5 208 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 NID2Q14112 1375 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 KPNA6O60684 536 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 NR3C2P08235 984 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 SMPD1P17405 629 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 RXRAP19793 462 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 CPT1AP50416 773 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 KCNA10Q16322 511 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D5Q92609 795 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 DNAH12Q6ZR08 3092 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PQY0 241 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 TGFB3P10600 412 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 CCND2P30279 289 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 LRRC26Q2I0M4 334 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 GPR153Q6NV75 609 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 TOX2Q96NM4 488 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 COL20A1Q9P218 1284 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 ADCY6O43306 1168 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 ASGR1P07306 291 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 SYN1P17600 705 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 RTP1P59025 263 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 APOBRQ0VD83 1088 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PGM5Q15124 567 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 GNPTABQ3T906 1256 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 MCTP2Q6DN12 878 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD1Q15327 319 aa15.35■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms