RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	PXMP2	Q9NR77	195 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPFIA3	O75145	1194 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACLY	P53396	1101 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNX17	Q15036	470 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNA10	Q16322	511 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM60	Q495X7	471 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF180	Q86T96	592 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RMDN3	Q96TC7	470 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RGS20	O76081	388 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASGR1	P07306	291 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMARCA1	P28370	1054 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGM5	Q15124	567 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE2S	Q16763	222 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	C8orf34	Q49A92	452 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RUFY3	Q7L099	469 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	MEIS2	O14770	477 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	NR3C2	P08235	984 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	POLR2M	P0CAP2	368 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMA5	P28066	241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNAQ	P50148	359 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RCAN1	P53805	252 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	NKX3-2	P78367	333 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGD1	P98174	961 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXL16	Q8N461	479 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRO3102	Q9H379	93 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	DTNB	O60941	627 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP2R5B	Q15173	497 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAF1	Q9H063	256 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	STXBP3	O00186	592 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SORBS3	O60504	671 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	EVC	P57679	992 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMC6	P62333	389 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	NTRK3	Q16288	839 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	LY6K	Q17RY6	165 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCFD2	Q8WU76	684 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHKB	Q93100	1093 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGBD1	Q96JS3	809 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	IWS1	Q96ST2	819 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRIN2D	O15399	1336 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIK3CD	O00329	1044 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-208	ENST00000475959	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36

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