RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 TXNP10599 105 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 EDNRBP24530 442 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 PPP2R5BQ15173 497 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 CHST3Q7LGC8 479 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 POLR3EQ9NVU0 708 aa13.17□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 SNHG28P0DPA3 235 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 CPT1AP50416 773 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 LY6KQ17RY6 165 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 TCTN1Q2MV58 587 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 MFSD6Q6ZSS7 791 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 AFG1LQ8WV93 481 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 TAAR1Q96RJ0 339 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 CTAGE1Q96RT6 745 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.31e-22■■□□□ 11.6
ACTB-209ENST00000473257 VAT1LQ9HCJ6 419 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.16□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 KDM4AO75164 1064 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 KCNQ1P51787 676 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 SCFD2Q8WU76 684 aa13.15□□□□□ -0.3
ACTB-209ENST00000473257 LCHNA4D1U4 455 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 A6NJR5 290 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 B4E1Z4 1266 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 IGHDP01880 384 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 IQCF3P0C7M6 154 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 SDSP20132 328 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 GPNMBQ14956 572 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 CCDC62Q6P9F0 684 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ADGRF4Q8IZF3 695 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 PNMA1Q8ND90 353 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 WDR19Q8NEZ3 1342 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 COL9A1P20849 921 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ARHGAP1Q07960 439 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 QRICH1Q2TAL8 776 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 RETREG2Q8NC44 543 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 KAT2BQ92831 832 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 IL25Q9H293 177 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 NOD1Q9Y239 953 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ZMYM6O95789 1325 aa13.13□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ZNF213O14771 459 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 MMP3P08254 477 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ZNF286BP0CG31 522 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 TAP1Q03518 808 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 PTGISQ16647 500 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 NFRKBQ6P4R8 1299 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 HERC6Q8IVU3 1022 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 DNERQ8NFT8 737 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ESR2Q92731 530 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 WNT8BQ93098 351 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 TTC14Q96N46 770 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 RMDN3Q96TC7 470 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ALG1Q9BT22 464 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 KAT14Q9H8E8 782 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 MTCH2Q9Y6C9 303 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 RAD50Q92878 1312 aa13.12□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 PTPRSQ13332 1948 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 TANC1Q9C0D5 1861 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 OPLAHO14841 1288 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.312e-12■□□□□ 9.3
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 BMP1P13497 986 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 DEFB103AP81534 67 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 HIC1Q14526 733 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 FAM117BQ6P1L5 589 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 ZSWIM5Q9P217 1185 aa13.11□□□□□ -0.31
ACTB-209ENST00000473257 MTUS1Q9ULD2 1270 aa13.11□□□□□ -0.31
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